Flynn Hawkings, um jovem pirata cansado de ser motivo de chacota em sua vila, decide iniciar uma busca para encontrar o mais famoso dos tesouros, a espada do Capitão Freckles, um velho e implacável capitão pirata. Mas nada é o que parece, Flynn acaba sendo vítima de uma maldição que recai sobre a espada, o espírito capturado do próprio capitão. Por causa disso, Flynn será forçado a iniciar uma jornada junto com o espírito do velho capitão para quebrar a maldição.
Flynn, um jovem pirata, decide iniciar uma perigosa jornada em busca do mais valioso dos tesouros: a espada do capitão Freckles. Mas, para sua surpresa, a espada está possuída pelo espírito do velho capitão. Agora ambos terão que enfrentar os perigos da ilha e a maldição que recai sobre o tesouro.
Flynn & Freckles é uma visão em terceira pessoa, jogo para um jogador com uma grande quantidade de exploração e combate. Como Flynn teremos que lidar com uma série de plataformas, quebra-cabeças e lutar contra um monte de inimigos.
F&F dá-nos a oportunidade de desfrutar, mais uma vez, de um jogo de plataforma 3D, ao estilo old school dos anos 90, com uma abordagem artística e técnica renovada, e tudo girado em torno de um fantástico cenário pirata.