Em 2011, Sergey Ulasen descobriu o STUXNET, um worm de computador malicioso, inicialmente espalhado pelo Microsoft Windows, e direcionado aos sistemas de controle industrial da Siemens, definido como uma ameaça adormecida, aguardando um gatilho para iniciar sua ativação. O STUXNET é o primeiro malware descoberto que espiona e subverte sistemas industriais e o primeiro a incluir um rootkit de controlador lógico programável (PLC). O worm foi encontrado infectando especialmente usinas nucleares e sistemas de perfuração de petróleo. O ATOMINE, como o STUXNET, é um vírus que precisa ficar mais forte para alcançar e, eventualmente, infectar e compilar-se no código-fonte de destino. A voz eletrônica ao fundo e diversos elementos na tela, informam ao jogador qual é o alvo da corrida.
ATOMINE é um rogue-lite de tiro processual com dois sticks ambientado em um mundo virtual com design minimalista, onde o jogador narra na tela os eventos reais do STUXNET, a primeira arma criada na forma de vírus de computador. Em cada corrida, o jogador deve limpar a área do nível de todos os inimigos para desbloquear o portal para o próximo nível. Durante a corrida, todos os inimigos mortos deixarão no chão XPs, energia e/ou módulos de armas.