O jogo segue a história de Resalin Stout, uma garota que vive na Ilha Kurken em busca de aventura. Em um dia de verão, ela encontra um barco a remo abandonado e se aventura no continente com seus amigos Lent Marslink e Tao Mongarten. Ao longo do caminho, salve a filha de um comerciante viajante e conheça o alquimista Empel Vollmer com sua companheira Lila Decyrus, que inicia Ryza no caminho do aprendizado da alquimia e suas aventuras interligadas e logo descobre a verdade real sobre sua casa.
O próximo jogo da franquia Atelier e o início de uma nova série de jogos.
O sistema de coleta foi redesenhado, os itens encontrados são os mesmos, mas serão necessárias ferramentas ou ações diferentes para encontrá-los nos pontos de coleta.
O sistema de criação foi atualizado e um novo sistema de criação de itens foi adicionado, a ser revelado posteriormente.
O combate por turnos está sendo alterado de alguma forma para torná-lo mais tenso, também a ser revelado mais tarde.