O jogo se passa dois anos após o original, que acompanhava um agente soviético novato da ATOM, encarregado de se aventurar nos ermos pós-apocalípticos da URSS, várias décadas após uma troca nuclear com a OTAN. Esse agente descobriu uma nova ameaça que poderia destruir os remanescentes da humanidade já dispersos.
Na sequência, os jogadores são enviados para uma metrópole em ruínas que pode conter o que a humanidade precisa para se defender da ameaça revelada no final do jogo original. Além de uma nova história, Trudograd apresenta inúmeras melhorias, ajustes e atualizações que foram solicitadas pela comunidade desde o lançamento do primeiro jogo, há quase dois anos.
Atom RPG: Trudograd é um RPG pós-apocalíptico baseado em turnos, que continua a história do Atom RPG como uma sequência/expansão independente e segue as tradições estabelecidas pelos cRPGs clássicos, como os primeiros títulos Fallout e Wasteland.