A protagonista, Mihara Suzu, uma estudante da Akarinkai Senior High School (comumente chamada de “Akarin”), estava indo para a escola com seus amigos de infância Otonari Kanade e Shizuma Souta, junto com sua melhor amiga Matsuri Ayame, como de costume. Quando chegaram aos portões da frente, ouviram uma certa história do presidente do conselho estudantil de Akarin High, Aoba Taiga:
“A verdade é que um dos alunos desapareceu.”
De acordo com a história de Taiga, durante a noite anterior, um estudante da Akarin High School desapareceu depois de agir como uma pessoa diferente; comportando-se violentamente enquanto brincava com seus amigos. Embora a história os preocupasse, o sinal do início da primeira aula os obrigou a encerrar a conversa.
No dia seguinte, o que Suzu e suas amigas viram no pátio da escola foi o menino desaparecido. Ele tinha uma aparência bizarra e foi crucificado.
Um estranho incidente que atormentou a pacífica escola.
A partir daí, inicia-se um mistério entremeado pelo amor e pela loucura. Como isso vai acabar?
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