Ninja Gaiden Sigma Plus é uma versão do Ninja Gaiden Sigma. Assim como o modo “Ninja Dog” de Ninja Gaiden Black, o Sigma Plus apresenta uma dificuldade mais fácil chamada modo “Hero”, tornando-o mais acessível para jogadores casuais. Ele também aproveita os recursos adicionais que o Vita oferece, incluindo mira giroscópica em primeira pessoa (ao inclinar o PlayStation Vita, o jogador pode ajustar o ângulo da câmera nos modos de visualização em primeira pessoa), controles traseiros do touchpad (tocar nos símbolos usando a parte traseira touchpad permitirá que Ryu aumente o poder de seu Ninpo) e controles de tela sensível ao toque (os jogadores podem entrar no modo de primeira pessoa tocando na tela sensível ao toque). Além disso, Ninja Gaiden Sigma Plus oferece novos conjuntos de acessórios que Ryu e Rachel podem equipar.