Uma onda de eventos misteriosos sacode a terra, e tudo está ligado a uma criatura misteriosa, um ex-aliado transformado em um temível arqui-vilão. O que significa que Van Helsing fará o que sabe fazer de melhor: ele empunha armas, prepara seus truques mortais e caça o monstro mais perigoso que já existiu... e desta vez é pessoal. Ele está preparado para fazer qualquer coisa para atingir seu objetivo, até mesmo para enfrentar o segredo mais obscuro sobre o nascimento da Borgovia moderna.
Em Van Helsing III, a guerra civil acabou em Borgovia, mas o futuro parece sombrio. A cidade da ciência estranha está em ruínas, facções em conflito e criminosos lutam pelo poder e um estranho culto profetiza a chegada do "fim dos tempos".