Rogue Galaxy é um RPG de ação ambientado em um universo de fantasia futurista, no qual o jogador se move por um ambiente contínuo sem tempo de carregamento entre a exploração do mundo superior e as batalhas. As batalhas ocorrem como encontros aleatórios, Rogue Galaxy usa um sistema de combate hack and slash em tempo real no qual o jogador luta com um grupo de três personagens. O jogador tem controle direto sobre apenas um personagem, embora possa alterar qual personagem é a qualquer momento. Os dois NPCs lutam independentemente do personagem do jogador, com base em uma estratégia selecionada antes da batalha. As estratégias disponíveis incluem lutar de forma especialmente agressiva, mirar em um inimigo específico ou simplesmente não lutar. A estratégia também pode ser alterada a qualquer momento durante a batalha. Além disso, o jogador pode emitir ordens específicas aos NPCs durante o combate, como fazer com que usem um item ou ativem uma de suas habilidades especiais.