Em KILLING FLOOR 2, os jogadores descem à Europa continental depois de esta ter sido invadida por clones horríveis e assassinos chamados Zeds, criados pela corporação Horzine. O surto de Zed causado pelas experiências falhadas da Horzine Biotech espalhou-se rapidamente com um ímpeto imparável, paralisando a União Europeia. Há apenas um mês, o primeiro surto de Zed do KILLING FLOOR original atingiu Londres; agora os espécimes clones estão por toda parte. A civilização está em desordem, as redes de comunicação falharam, os governos entraram em colapso e as forças militares foram sistematicamente erradicadas. Os povos da Europa estão agora concentrados na autopreservação, tendo os poucos sortudos que sobreviveram escondido.
Mas nem todos perderam a esperança; um grupo heterogéneo de civis, soldados e mercenários uniu-se para combater os surtos a partir de bases financiadas pelo sector privado em toda a Europa. Quando um surto de clones de espécimes é detectado, os jogadores são enviados para zonas quentes repletas de Zed para exterminar todas as ameaças usando todos os meios necessários.
Em Killing Floor 2, os jogadores descem à Europa, onde o surto de Zed se espalhou rapidamente e ganhou um impulso imparável. Apenas um mês após a conclusão dos eventos do Killing Floor original, os clones estão por toda parte e a civilização está em desordem; os governos entraram em colapso e as forças militares desapareceram.